In der Fehlermeldung, dass Matomo keine Schreibrechte hat, wird angezeigt, unter welchem (Linux-)Benutzer PHP (und somit Matomo) läuft. Dafür wird (wenn shell_exec aktiviert ist) whoami ausgeführt, was den Namen des aktuellen (Linux-)Benutzers ausgibt.
Was dabei schiefgeht, kann ich nicht wirklich sagen, aber vielleicht hat der PHP-Benutzer am Server keinen Benutzername, wodurch whoami nichts zurückgeben kannst.
Das sollte aber auch ziemlich egal sein, da bei einem Shared-Hoster du den Benutzer der Dateien eh nicht ändern kannst.