Piwik 3 - Import logs - Muy lento

Hola,
Estoy importando logs a Piwik 3 y no puedo hacer que el proceso de importación pase de 5 request/seg.

Estoy importando desde dos máquinas iguales (ec2 m3.medium) con instalaciones iguales pero desde una importo a razón de 50 request/seg. y desde la otra a 5 request/seg. Cada archivo de log contiene alrededor de 5000 request.

Miró la base de datos y noto que las transacciones de una máquina son ejecutadas mucho más rápidas que las de la otra.

Además veo que los procesos en la máquina que lo hace más rápido están muchos más activos y un uso de CPU mucho más alto que la otra… pero las dos máquinas son iguales e instalaciones iguales.

No encuentro explicación para la diferencia de perfomance.

Servidor web: nginx + php-fpm
BD: Mysql (RDS db.m3.medium)