ja, so seh ich das auch: Downgrade des Plugin sollte eigentlich vermeidbar sein.
Das sofortige Löschen des Browser-Cache nachdem man den Boost (de-)aktiviert hat, reicht nach meiner Erfahrung aus.
In dem Zusammenhang auch: Die unmittelbar nach einem One-Click-Update immer wieder mal auftretenden Apache Error 500 (und höher), hängen wahrscheinlich auch mit einem aktiven Boost zusammen. Erst wenn man sich danach vergeblich durch alle möglichen Links geklickt oder mehrere refreshs gemacht hat, kam man dann irgendwann doch wieder aufs Matomo Dashboard. Sehr ärgerlich war das immer.
Seit ich den Boost vor einem update immer ausschalte und den Cache lösche, habe ich den Fehler jedenfalls nicht mehr.
Das gilt für Hosting bei Strato. Mit anderen habe ich keine Erfahrung.